高度なRNA-Seq解析に最適

最先端の遺伝子解析技術を提供する株式会社・理研ジェネシスでは、シーケンサーを利用して行う遺伝子発現の定量方法・RNA-Seq解析も行っています。

次世代シーケンサーであるNGSによって塩基配列を定め、参照配列へとマッピングした上で転写物の配列構築やレベル算出、アノテーション付与を行うといった形で進められます。

複数におよぶサンプル群が発現した場合、その集合における発現レベルを個体ずつに比較するといった流れです。

これによって遺伝子発現レベルだけでなく、スプライシングパターンも解析が可能となり生体内の変動・発現といった現象を網羅的に解析することができます。

特異的な遺伝子発現パターンも検出でき、さらにはパスウェイ解析やGO解析といった別の検出および解析方法と併用することでより実用的なデータも取得可能です。

解析目的・用途やRNAの品質に見合った適切な方法を選ぶことができ、がんの原因である融合遺伝子の調査・発掘もできるという優れた技術です。

探索方法はペアエンドリード配列を用いたものであり、2種類のソフトウェアを活用しながら融合遺伝子の検出精度を高めています。

併用可能なパスウェイ解析はヒトに加えてマウス・ラットにも対応でき、最新鋭のKEGGデータベースに基づいて行われるのが特徴です。

解析結果は参照配列に対してリード配列をマッピングすることによって検出されたものであり、ジャンクション構造予測を行った結果のデータとなります。